Eclipse/プラグイン開発のTIPS集/ソースコードを解析するパーサASTParserでもちょっとやりましたが、パッケージ・エクスプローラからSelection経由でICompilationUnit?*1を取得することができます。それは何とかっていうJavaプロジェクトに属しているわけですがそのJavaプロジェクトを操作する方法です。
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